UNC0638

UNC0638是选择性组蛋白赖氨酸甲基转移酶（HMTase）抑制剂，作用于G9a和GLP，IC50分别为< 15 nM和19 nM，有效且选择性地作用于多种表观遗传和非表观遗传靶点。

靶点

G9a (Cell-free assay)

GLP (Cell-free assay)

IC50

< 15 nM

19 nM

体外研究

UNC0638是一种有效的，选择性的，可渗透细胞的G9a和GLP的化学探针，相比于BIX01294，毒性/功能比小于6，其毒性/功能比大于100。UNC0638是一种有效的G9a和GLP抑制剂，对广谱的表观遗传和非表观遗传靶点有选择性。UNC0638对SET7/9 (a H3K4 HMTase)，SET8 (a H4K20 HMTase)，PRMT3，以及SUV39H2有大于10,000倍的选择性。在MDA-MB-231细胞中，UNC0638 (48 h处理)以浓度依赖的方式降低H3K9me2水平，IC50 是81 nM。UNC0638处理各种细胞系导致较低的全局H3K9me2水平降低，这与用shRNA降低G9a和GLP观测到的效果是一致的。UNC0638显著降低MCF7细胞的克隆形成能力，降低G9a调控的內源基因的启动子区H3K9me2的丰度，同时影响microRNAs。在小鼠胚胎干细胞中，UNC0638以浓度依赖的方式重新激活G9a沉默的基因和一个报告基因，同时不促进分化。

体内研究

在小鼠中进行的药物代谢和药代动力学研究表明，UNC0638经静脉注射、腹腔注射或口服途径给药，在体内清除率高、半衰期短、高体积分布和低暴露量。

EPZ5676

MB4407

GSK126

MB3680

RG108

1 mg

5 mg

10 mg

1 mM

1.9618 mL

9.8091 mL

19.6182 mL

5 mM

0.3924 mL

1.9618 mL

3.9236 mL

10 mM

0.1962 mL

0.9809 mL

1.9618 mL

50 mM

0.0392 mL

0.1962 mL

0.3924 mL

SAHH耦合试验:
这个实验在腺苷脱氨酶的作用将腺苷转换为肌苷，利用SAHH分解甲基转移酶产生的S-腺苷高半胱氨酸，形成同型半胱氨酸和腺苷。同型半胱氨酸的浓度通过偶联荧光基团ThioGlo测定。IC50测定，反应缓冲液如下：25 mM 磷酸钾缓冲液pH 7.5，1 mM EDTA，2 mM MgCl2，含 5 μM SAHH 的0.01% Triton X 100，0.3 U/mL 腺苷脱氨酶，25 μM SAM，以及15 μM ThioGlo。G9a, EHMT1, SETD7, SETD8, PRMT3以及SUV39H2分别在25 nM, 100 nM, 200 nM, 250 nM, 1 μM 和100 nM的浓度下测量。UNC0638以4 nM 到 16 μM的浓度加入缓冲液。孵育2分钟后，加入组蛋白多肽触发反应，G9a 中加入10 μM H3(1-25)，EHMT1中加入20 μM H3(1-25)，SETD7中加入100 μM H3(1-25) ，SETD8中加入500 μM H4(1-24)，PRMT3中加入10 μM H4(1-24) ，SUV39H2中加入200 μM H3K9Me1 (1-15)。在384孔板中，用Biotek Synergy2 plate reader在360/40 nm 感光片和528/20 nm滤光片下观测甲基化反应过程中荧光的变化，持续20分钟。扣除实验背景后，用Sigmaplot计算IC50。计算两组独立实验的标准差。

细胞实验：

• Cell lines:MCF7, U2OS 和 H1299细胞
• Concentrations:3 μM
• Incubation Time:65 h
• Method:

将约为5×105的细胞铺于75 cm2烧瓶中。MCF7和U2OS细胞培养于不含酚红、而包含Earl’s salts、10% FBS、1 mM Pyruvate、2 mM Glutamine和1×非必需氨基酸的MEM培养基中。H1299细胞培养于含酚红和10% FBS、1×Anti-Anti的DMEM培养基中。向培养基中加入3 μM UNC638A或等体积DMSO。将烧瓶置于37℃/5% CO2培养箱中。65小时后，收集培养基、离心以移除其中细胞碎片。将10-15 mL培养基与HPLC级别的氯仿混合，轻轻摇晃，然后静置，知道有机层和水层分离开来。收集有机相，用无水Na2SO4进行干燥，然后真空中收集浓缩。剩余残渣溶于100 μL 甲醇，进行后续分析。

动物实验：

• Animal Models:Swiss albino mice
• Formulation:–
• Dosages:IV, 1 mg/kg; PO, 3 mg/kg; IP, 2.5 mg/kg
• Administration:i.v./i.p./oral